Khi doanh nghiệp sản xuất thực phẩm hoặc sản phẩm liên quan đến thực phẩm áp dụng hệ thống HACCP sẽ mang lại các lợi ích dưới đây:

1. Đối với người tiêu dùng

- Giảm nguy cơ ngộ độc thực phẩm và các bệnh truyền qua thực phẩm.

- Tăng sự tin cậy vào việc cung cấp và tiêu dùng thực phẩm.

- Cải thiện chất lượng cuộc sống (sức khoẻ và kinh tế – xã hội).

2. Đối với doanh nghiệp

- Nâng cao uy tín chất lượng đối với sản phẩm của mình, tăng tính cạnh tranh, khả năng chiếm lĩnh và mở rộng thị trường, đặc biệt đối với thực phẩm xuất khẩu.

- Được sử dụng dấu hiệu chứng nhận HACCP, từ đó độ tin cậy với khách hàng càng cao.

- Việc áp dụng hệ thống HACCP trong sản xuất, kinh doanh thực phẩm là cơ sở giúp doanh nghiệp trong việc tiếp thị về cam kết của doanh nghiệp với người tiêu dùng trong việc bảo đảm an toàn thực phẩm của sản phẩm do mình sản xuất, kinh doanh. Tạo lòng tin với người tiêu dùng và bạn hàng, nhờ đó gia tăng được số lượng tiêu dùng sản phẩm.

- Giúp doanh nghiệp cải tiến năng lực quản lý an toàn thực phẩm, cải tiến quá trình sản xuất và cải thiện môi trường, giảm chi phí do giảm số lượng sản phẩm hỏng và phải thu hồi

- Là căn cứ để cơ quan chức năng có thẩm quyền xem xét tạo điều kiện thuận lợi cho doanh nghiệp trong việc công bố hợp quy hoặc công bố phù hợp quy định an toàn thực phẩm và giảm tần suất kiểm tra đối với cơ sở và giám sát định kỳ các lô sản phẩm.

- Là cơ sở bằng chứng đảm bảo điều kiện thuận lợi cho việc đàm phán, ký kết hợp đồng thương mại trong nước cũng như xuất khẩu.

- Là cơ sở bằng chứng của chính sách ưu tiên đầu tư, đào tạo của Nhà nước cũng như các đối tác nước ngoài